Την Τετάρτη 20 Οκτωβρίου 2021 μπαίνει σε πιλοτική εφαρμογή ο έλεγχος των επιβατών και των αποσκευών τους μέσα από τις εγκαταστάσεις του Επιβατικού Σταθμού.
Ο Οργανισμός Λιμένος Ηρακλείου με την εταιρία ασφάλειας ICTS η οποία έχει αναλάβει το έργο φύλαξης του λιμένος Ηράκλειου, θα προβεί πιλοτικά στον έλεγχο των επιβατών και των αποσκευών τους μέσα από τις εγκαταστάσεις του Επιβατικού Σταθμού και θα ελεγχθούν με μηχανικά μέσα /μαγνητικές πύλες και σαρωτές αποσκευών X- RAY μηχανήματα οι επιβάτες και οι αποσκευές τους που ταξιδεύουν με τα πλοία της γραμμής στον λιμένα του Πειραιά σύμφωνα με την κείμενη νομοθεσία .
Επισημαίνεται ότι θα βρίσκονται λεωφορεία στην είσοδο του λιμένος καθώς και εσωτερικά του λιμένος για να μεταφέρουν το επιβατικό κοινό και τις αποσκευές τους στον Σταθμό Επιβατών και μετά από τον έλεγχο θα μεταφέρονται έμπροσθεν των πλοίων που θα ταξιδέψουν με την επισήμανση ότι οι επιβάτες να έχουν μαζί τους τα εισιτήρια και την αστυνομική τους ταυτότητα.